Академгородок всегда был частью Новосибирска, одновременно имея некий отдельный статус и положение. За отделение городка от города есть аргументы и «за», и «против».
Губернатор Василий Юрченко считает, что Академгородку лучше оставаться частью Новосибирска. Ведь на его нужды выделяются и будут выделяться значительные средства. Мэр Новосибирска Владимир Городецкий также является сторонником идеи сохранения «статус кво».
Законопроект об особом статусе академгородков России поступил в марте в Госдуму. В случае его принятия, подобные городки обретут статус отдельных муниципальных образований с собственным бюджетом и своими границами.